Cauzele frecvente ale contaminării produselor alimentare includ bacteriile, virușii și paraziții care intră în procesul de producție în timpul fazei de creștere, de recoltare, de procesare, de expediere sau de pregătire. Alimentele care sunt în mod special susceptibile la contaminare dăunătoare includ materiile prime și - să mănânce alimente, cum ar fi produsele, care nu se prepară înainte de consum.
E. coli este unul dintre cele mai frecvente contaminanți și este rezultatul unei carne de vită neacoperită care a fost contaminată cu fecale în timpul sacrificării. Controlarea contaminată a alimentelor cu salmonella este frecventă în bucătării în care bucătarii manipulează carne și păsări de curte brute, folosind unelte sau mâini nespălate care manipulează de asemenea mâncăruri gătite sau gata pentru consum, ducând la intoxicații cu alimente pentru consumatori.