Rădăcinile care putrezesc în partea de jos suferă de putregaiul de flori. Această condiție semnifică o deficiență de calciu și dispare repede odată ce plantele primesc calciu adecvat. Blocarea putregaiului, de asemenea, afectează vinetele, pepeni și ardei.
Cea mai obișnuită cauză a calciului slab al solului este o deficiență nutrițională a solului în sine. Acest lucru se întâmplă adesea atunci când grădinarii neglijează adăugarea de îngrășăminte la plante și nu practică rotația plantelor. O altă cauză a calciului inadecvat al solului este aciditatea excesivă a solului. Când pH-ul solului scade sub 6,2, calciul devine prins și nu mai este disponibil pentru absorbția plantelor. Alte cauze ale unor niveluri scăzute de calciu sunt fertilizarea excesivă și umiditatea inadecvată. Tomatele necesită cea mai mare umiditate în timpul și imediat înainte de fruct. Adăugarea de mulci în jurul bazei fiecărei plante și umplerea acestora cu un furtun de dedurizare reduce probabilitatea de putrezire a capului de flori din cauza setei.
Cea mai rapidă și cea mai eficientă metodă de a crește pH-ul solului este adăugarea de var până când pH-ul ajunge la 6,8. Varul crește biodisponibilitatea calciului existent și adaugă mai mult calciu în sol. Atunci când putregaiul de trandafiri are loc în sol fără probleme de pH, adăugarea de var nu este adecvată deoarece va crește pH-ul în trecut.