Brânza de mozzarella prelucrată poate fi înghețată și păstrează timp de până la șase luni în congelator. Brânza de Mozzarella își pierde umiditatea atunci când este înghețată și dezvoltă o textura friabilă. Din cauza acestei texturi, brânza de mozzarella dezghețată este potrivită doar pentru utilizările în care este topită.
Brânza proaspătă de mozzarella nu îngheață, nici soiurile procesate și nu este adecvată pentru îngheț. Mozzarella dezghețată nu poate fi înlocuită în rețete care necesită brânză proaspătă. Acest lucru se datorează diferențelor de aromă și textura. Mozzarella cu conținut scăzut de grăsime are mai multă apă decât soiurile cu grăsimi complete, ceea ce afectează cât de multă umiditate este pierdută în timpul înghețării și cât de bine se topește atunci când este dezghețată.