Făina brută poate fi periculoasă pentru a fi consumată din cauza nivelurilor ridicate de bacterii. Făina nu trece, în general, printr-un proces tratat termic pentru a distruge agenții patogeni. Acești agenți patogeni, atunci când sunt consumați în produse crude, cum ar fi aluatul crud brut, pot face rău consumatorilor.
În 2009, un focar de E. coli a apărut din cauza aluatului cookie al casei Nestle Toll House, după cum reiese din arhiva știrilor WebMD. Au existat 77 de persoane în 30 de state afectate de epidemie și toate au fost după ce au mâncat aluatul cookie-urilor din Nestle Toll House fără a le coace mai întâi. 35 de persoane au fost spitalizate, ceea ce a determinat retragerea imediată a 3,6 milioane de pachete de aluat cookie.
La început, vinovatul pentru focar a fost considerat a fi ouăle crude, însă, după o examinare mai atentă, CDC și FDA au fost lăsați să-și asume doar contaminantul făină brută. În acel moment nu a trecut prin nici un proces de tratare termică pentru a distruge agenții patogeni ca și celelalte ingrediente găsite în aluatul cookie. De la acel incident, mai mulți producători, inclusiv Nestle, au început să pună în aplicare un proces de încălzire în fabricile lor pentru a reduce bacteriile din făină, în speranța de a evita apariția altor focare.