Semințele de pepene verde sunt comestibile și conțin urme de fier, zinc și proteine. O persoană ar trebui să consume câteva sute de semințe pentru a obține 1 până la 2 grame de fier sau zinc. Există 1 gram de proteine în 24 de semințe.
În Asia, semințele de pepene verde sunt prăjite, condimentate și consumate ca o gustare. Ele sunt, de asemenea, măcinate în făină și folosite pentru a face pâine. Coaja de pepene verde este de asemenea comestibilă.
Pepenii fără semințe nu au fost modificați genetic. Acestea apar prin hibridizare atunci când pereții diploizi și tetraploide sunt traversați. Duplicatele pepene verzi conțin două seturi de cromozomi, iar pepenele verzi conțin patru seturi de cromozomi.