Migdalele se pot răni dacă nu sunt depozitate corespunzător. Deși migdala este tehnic o sămânță, este utilizată ca o nuci și are un conținut ridicat de grăsimi. Acest conținut de grăsimi este ceea ce face ca migdala să fie rancidă rapid.
Migdalele nesărate au cea mai lungă durată de conservare. Shell-urile trebuie să fie intacte, fără mucegai și să aibă un miros curat și nuci. În mod ideal, cele mai bune migdale de cumpărat vin în recipiente etanșe, în care nu sunt expuse la căldură sau umiditate.
Odată ajuns acasă, migdalele trebuie depozitate într-un loc răcoros și uscat. Este mai bine să le păstrați în frigider pe termen lung și mai bine să le păstrați în congelator.