Majoritatea aprovizionării cu alimente au fost achiziționate de-a lungul drumului, dar expediția a ținut, de asemenea, un stoc de carne de vită uscată, făină și whisky achiziționate înainte de călătorie. Aceste stocuri au dispărut rapid, totuși, lăsând expediția în funcție de ceea ce putea vâna și furajează.
O inovație alimentară pe care expediția Lewis și Clark a profitat-o a fost "supa portabilă", o pastă groasă creată prin fierberea și uscarea cărnii de vită, a ouălor și a legumelor. Un precursor al supe-ului condensat comun în supermarketurile moderne, a ajutat expediția să treacă pe parcursul unor perioade mai slabe. Partidul a părăsit civilizația cu 193 de lire sterline din această dispoziție de urgență.
Expediția Lewis și Clark a descoperit, de asemenea, o altă tehnică de supraviețuire atunci când au alergat puțin pe sare pentru a-și păstra carnea. Membrii expediției au scos apă din ocean și l-au fiert, evaporându-l până când numai sarea a rămas. Această sare, împreună cu tehnicile de fumat și uscare, au fost vitale pentru păstrarea rațiilor grupului.