Lewis și Clark au traversat Muntele Bitterroot, un segment nordic al Munților Stâncoși. Deși vârfurile celor de la Bitterroots, de la 9000 la mai mult de 11.000 de picioare, au găsit o rută spre vest peste munți Lolo Pass, care se află la o altitudine de 5.236 de metri.
Unul dintre obiectivele primare ale expediției lui Lewis și Clark a fost să caute Pasajul de Nord-Vest, o cale de apă ipotetică de la Oceanul Atlantic la Oceanul Pacific. Alte obiective au inclus contactul diplomatic cu americanii nativi, extinderea comerțului cu blănuri în noi teritorii și explorarea râului Missouri, a Pacificului de Nord-Vest și a cumpărării recent achiziționate de Louisiana. Ei au pornit râul Missouri în mai 1804 cu alți 33 de bărbați. În Dakota de Nord, au construit Fort Mandan în care să aștepte iarna. În aprilie 1805, au continuat de-a lungul Missouri până când au ajuns în Munții Stâncoși, unde trebuiau să continue cu călătoarea. Pe cealaltă parte a diviziunii continentale, au continuat cu canoe în josul râurilor Clearwater și Snake până când au ajuns pe râul Columbia, ceea ce ia dus restul drumului către Pacific.
Lewis și Clark și bărbații expediției lor, numiți Corpul Discovery, au ajuns în St. Louis în septembrie 1806 după ce au călătorit aproape 8000 de mile. Au fost primiți ca eroi de către președintele Thomas Jefferson, Congresul și publicul american.
