Aproximativ 100 de specii de plante și ierburi conțin cafeină. Cofeina este mai puțin frecventă în fructe, dar nucile conțin cofeină, la fel ca semințele de la fructul plantei Guarana și a copacului de cacao .
Plantele Guarana produc fructe mici care au seminte cu o concentratie mai mare de cafeina decat boabele de cafea. Unele specii de plante de cafea produc fructe roșii și violete comestibile numite cireșe. Aceste cireșe conțin semințe care au cofeină. Lemon, grapefruit și plantele portocalii conțin cofeina în frunzele și florile lor, dar nu și în fructele.
Majoritatea fructelor care provin de la plantele cu flori nu conțin cofeină. Cafeina naturală găsită în plante și semințe acționează adesea ca un mecanism de apărare pentru a descuraja erbivorele să mănânce planta.