Antagonismul microbian este metoda utilizării culturilor stabilite de microorganisme pentru a preveni intruziunea tulpinilor străine. Când este introdus într-un mediu deja colonizat, o tulpină invazivă de bacterii tinde să nu se dezvolte și poate merge complet disparut.
Un exemplu de antagonism microbian în corpul uman este rezistența bacteriilor introduse în gura la tulpini noi care pot fi introduse prin contactul dintre gura și gură. După un sărut, de exemplu, noi bacterii sunt introduse în mediul ostil al unei guri străine. Odată ajuns acolo, creșterea bacteriilor invazive este inhibată de compușii antimicrobieni secretați de flora nativă, precum și de competiția strânsă pentru resurse.
