Schimbările climatice reprezintă cea mai mare amenințare la supraviețuirea pinguinilor și cea mai dificilă pentru a contracara; pinguinii sunt protejați de daunele cauzate de Actul asupra speciilor pe cale de dispariție din 1973 și sunt salvați de grupurile de mediu în timpul scurgerilor de petrol, dar habitatele lor în scădere și consumul redus de alimente îngreunează reproducerea sau prosperarea acestora. Chiar și pinguinii din afara Antarcticii sunt amenințați de schimbările climatice. Sărbătorile de pinguini africane pe sardine și anchovii care urmează curenții de pe insule mici, dar schimbările climatice determină fluxurile să se deplaseze mai departe de casele pinguinilor și din afara lor.
Pinguinii sunt, de asemenea, amenințați de expedițiile comerciale de pescuit. În timp ce unii pescari participă la eforturile de conservare și îngrijesc animalele rănite în viață, pinguinii trebuie să concureze cu oamenii pentru alimente. Pinguinii se confruntă, de asemenea, cu amenințări din cauza prădătorilor lor naturali: rechini, balene ucigătoare, leii de mare și sigilii de leopardi.