Iodul este adesea folosit pentru a pata celulele din ceapa inainte de examinarea microscopica pentru a creste vizibilitatea celulelor. Multe celule, inclusiv cele de ceapa si alte legume, sunt adesea transparente. Atunci când celulele neintenționate sunt văzute sub microscop, lumina trece direct prin diferitele structuri ale celulelor care dezvăluie puțin sau deloc detalii. Prin contrast, atunci când se utilizează iod sau alte coloranți, celula absoarbe colorantul în diferite organele și structuri, ceea ce blochează lumina și permite ochiului observatorului să detecteze detaliile celulei.
Iodul nu este singurul colorant utilizat în examinările microscopice. Iodul, colorantul alimentar, verde malachit și albastrul de metilen sunt coloranți obișnuiți și ușor accesibili. Malachit verde și albastru de metilen sunt ambele disponibile la magazinele de acvariu de specialitate, dar iodul și colorarea alimentelor sunt disponibile la cele mai multe magazine de droguri și magazine alimentare.
Diferitele tipuri de structuri celulare funcționează mai bine cu coloranți diferiți. Din acest motiv, oamenii de stiinta pot folosi un colorant care este adaptat la organelle specifice. În plus, oamenii de știință pot utiliza coloranți multipli care evidențiază multe părți diferite ale unei plante sau a celulelor animalelor. Oamenii de știință trebuie să aibă întotdeauna grijă, deoarece coloranții nu numai că pătrund celulele. De asemenea, ele pot pata pe mâinile și pe pielea oamenilor de știință.
