Temperatura afectează procentul de semințe care germinează și rata de germinare. Semințele păstrate la temperaturi mai ridicate sunt mai predispuse la deteriorare și nu la germinare. Odată ce semințele încep să germineze, temperaturile mai mari stimulează germinarea mai rapidă până la o temperatură optimă, după care declinul vitezei germinării.
Temperatura optimă pentru viteza de germinație variază în funcție de specie. Semințele uscate sunt mai susceptibile de a germina la temperaturi mai ridicate, dar semințele umede sunt mai puțin susceptibile de a germina la temperaturi mai ridicate. Alternarea dintre temperaturile reci și cele fierbinți poate stimula mai multe semințe umede să germineze. Unele specii de semințe sunt stimulate să germineze la temperaturi foarte scăzute.
