Potrivit conturilor de istorie orală de la Hidatsa, numele mamei lui Sacagawea era "Otter Woman" și tatăl ei era "Lodge Smoked". Această informație a fost oferită de un Hidatsa pe nume Bulls Eye, care a pretins nepotul lui Sacagawea.
Nu se știe prea multe despre viața timpurie a Sacagawei, cu excepția faptului că ea a crescut ca parte a tribului Shoshone și a fost răpită de tribul Hidatsa. Sacagawea a trăit printre oamenii Hidatsa până când sa căsătorit cu comerciantul francez canadian, Toussaint Charbonneau.
Bulls Eye contestă faptul că Sacagawea a fost Shoshone și a afirmat că era cu adevărat de origine Hidatsa. Orice versiune este adevărată, nu există informații suplimentare despre părinții ei.