Comandantul comandant al Armatei Confederate a fost Jefferson Davis, care a fost, de asemenea, președintele Statelor Confederate ale Americii între anii 1861-1865. Au existat mulți lideri ai Armatei Confederate care au servit sub Jefferson Davis. Câțiva generali cunoscuți de Confederate erau Robert E. Lee, John Bell Hood, Thomas "Stonewall" Jackson și Braxton Bragg.
În timp ce Bragg a condus armata din Tennessee în 1862, Jackson a luptat la prima bătălie de la Bull Run. Generalul Lee a fost un comandant pivot în timpul Războiului Civil. La sfârșitul războiului, el a predat ultima armată a Confederației de la Appomattox la generalul Ulysses S. Grant în aprilie 1865.
Războiul civil a durat între 1861 și 1865. În ceea ce privește forța de muncă, forțele sudice au fost depășite de două ori la unu. A fost un război costisitor în care au murit aproape 620 000 de soldați.