Apoenzimele sunt proteine care formează sisteme enzimatice active prin combinarea cu coenzime și stabilirea specificității sistemului pentru un substrat. Înainte de a intra în această sinteză, este adesea inactivă; înainte de a se alătura coenzimului sau cofactorului, este cunoscut și ca un zymogen sau proenzim. În unele cazuri, starea inițială conține câțiva aminoacizi suplimentari care apar înainte de a-și lua structura finală ca apoenzima.
Un apenenzim este doar o parte a structurii unei enzime mai mari. Activitatea enzimatică se bazează pe un lanț specific de proteine. Cofactorii sau coenzimele nu sunt întotdeauna organice, dar în general provin dintr-o vitamină. Cu toate acestea, un alt tip de cofactor este un activator de ioni metalici. Anorganic, ionii metalici se adună adesea cu legături covalente coordonate. Scopul nutriției necesare mineralelor este de a da ioni ai corpului care creează enzime atunci când sunt combinate cu alți atomi polari.
Apoenzimele formează diferite tipuri de asociații cu cofactori. Multe cazuri prezintă legături slabe, iar cele două se întâlnesc numai atunci când are loc o reacție. În alte cazuri, legăturile covalente le țin strâns împreună. Scopul cofactorului este de a schimba proteina în stare activă prin modificarea structurii sale sau prin desfășurarea în reacția însăși. Molecula pe care acționează enzima este substratul.
