Principala diferență între celulele prokaryotice și eucariote este că celulele eucaiote au un nucleu și organele legate de membrană, în timp ce celulele procariote nu au aceste structuri. Celulele procariote sunt cele mai simple dintre toate lucrurile vii și există doar ca bacterii unicelulare. Toate organismele multicelulare și bacteriile de ordin superior sunt compuse din celule eucariote.
Procarioții și eucariotele diferă și în ceea ce privește dimensiunea celulelor. Potrivit Universității din Maryland, celulele procariote sunt de obicei de circa 0,2 până la 2,0 micrometri în diametru, în timp ce celulele eucariote au între 10 și 100 micrometri în diametru. Deși ambele tipuri de celule pot avea flagel, structura acestor flageluri este diferită. Celulele procariotice constau din două blocuri de proteine, în timp ce cele ale celulelor eucariote sunt compuse din aranjamente complexe ale microtubulelor.
În timp ce celulele procariote nu conțin organele legate de membrană, ele conțin ribozomi. Cu toate acestea, acestea sunt mai mici decât ribozomii găsiți în celulele eucariote. ADN-ul celulelor procariote este de asemenea circular, mai degrabă decât liniar, așa cum este în eucariote. Cele două tipuri de celule se împart, de asemenea, în diferite moduri: celule procariote prin fisiune binară și celule eucariote prin mitoză. Reproducerea sexuală în prokaryotes implică numai transferul fragmentelor ADN între două celule, în timp ce reproducerea sexuală în celulele eucariote apare prin procesul de meioză.
