Ciupercile trăiesc în sol, în podele de pădure, în apă și chiar în plante, animale și în aer. Ciupercile cresc în aproape toate zonele planetei - ocupă atât biomase tropicale, cât și temperate zone. Ciupercile au diferite adaptări pentru a se potrivi climatului și condițiilor în care trăiesc: unele sunt mai poroase și mai potrivite pentru a trăi în pădurile tropicale și în zonele mlaștine, în timp ce altele au acoperiri exterioare extinse, asemănătoare coralului, ceea ce le permite să trăiască pe podeaua oceanică .
Ciupercile solului se găsesc în ecosisteme din întreaga lume; oriunde există sol, vor crește. Aceste ciuperci se bazează pe murdăria și solurile în care cresc pentru a le furniza vitamine și substanțe nutritive esențiale. Mijloacele solului sunt adesea găsite în creștere în apropierea speciilor de plante însoțitoare. În acest caz, plantele și ciupercile formează o relație reciproc avantajoasă în care planta furnizează ciupercile cu alimente din materie organică descompusă, iar ciupercile dau apă și substanțe nutritive către plante. Câmpurile acvatice locuiesc în apă sărată și apă dulce; în funcție de zona de rezidență, au o varietate de caracteristici speciale pentru a face față vieții în mediul lor. Sporii acestor ciuperci, precum cele ale ciupercilor care cresc în aer, se dispersează și se regenerează atunci când sunt purtate de vânt.