Rareori, un băiat și o fată pot fi gemeni identici. Această afecțiune, numită sindromul Turner, afectează foarte puține perechi de gemeni. Diferența de gen apare atunci când un ou și o pereche de spermă, care începe ca doi bărbați, își pierde o copie a cromozomului Y dominant atunci când se împarte.
Un băiat și o fată gemene pot fi identice, potrivit unui studiu din NCBI, deși această situație este foarte rară. De obicei, gemenii identici au același sex: ei sunt fie perechi, fie băieți sau fete. În cazuri rare, totuși, gemenii identici se formează dintr-un ovul și un spermatozoid care încep ca bărbați (împărtășind cromozomii XY), apoi se schimbă pentru a deveni o pereche de bărbați și femei. Aceasta se întâmplă atunci când o jumătate din oul fertilizat divizat pierde o copie a cromozomului său Y codificat genetic. Această eroare se întâmplă în general la începutul sarcinii. Copiii care formează includ un bărbat definit, care are cromozomii XY adecvați necesari pentru a crea sisteme și trăsături de reproducere masculine și o femeie cu cromozomi XO. Deși este clasificată ca feminină, fată din perechea duală prezintă trăsături exterioare ale sexului feminin, dar poartă doar o copie a cromozomului X, mai degrabă decât cromozomul XX folosit de biologi pentru a clasifica femelele ca atare. În plus, copilul de sex feminin lipsește adesea hormonii necesari pentru a crește corespunzător și pentru a reproduce; în consecință, ea va fi mult mai scurtă decât bărbatul și nu are o dezvoltare ovariană adecvată. Termenul oficial pentru această condiție este sindromul Turner. Este destul de rară și afectează foarte puține perechi de gemeni.