Cromozomii omologi poartă aceleași gene. Deși cromozomii poartă aceleași gene, fiecare cromozom dintr-o pereche omologă poate purta o altă formă a genei, numită o alelă. Un cromozom al fiecărei perechi omoloage este preluat de la fiecare părinte.
Organismele care conțin perechi de cromozomi care au aceleași gene sunt numite organisme diploide. Oamenii au o pereche de cromozomi care poartă aceleași gene deoarece aceasta este o măsură de siguranță împotriva erorilor și a mutațiilor. Pentru a ilustra, daca un organism avea doar un cromozom si cromozomul continea gena care codifica o proteina defecta, organismul ar putea sa nu poata functiona normal si ar putea muri. Pe de altă parte, dacă un organism avea două cromozomi care conțineau două gene, chiar dacă unul era defect, gena din celălalt cromozom poate codifica forma normală a proteinei și organismul poate supraviețui pe baza genei normale numai.
