Microorganismele unicelulare, numite anaerobe obligatorii, utilizează strict respirația anaerobă pentru producerea de energie. Exemple comune de anaerobe obligatorii sunt unele specii de bacterii, cum ar fi Clostridium tetani, Clostridium botulinum, Clostridium perfringens, Clostridium sporogenes Clostridium difficile.
Respirația anaerobă este procesul de producere a moleculei de energie înaltă adenozin trifosfat sau ATP, în absența oxigenului. În ceea ce privește toleranța la oxigen, microbii sunt clasificați în cinci: anaerobi obligați, aerobi obligați, microaerofili, aerotoleranți și facultativi.Anaerobii obligați nu sunt în măsură să supraviețuiască în prezența oxigenului din cauza lipsei de catalază și superoxid dismutază, care sunt enzime care catalizează defalcarea substanțelor nocive. Aceste organisme utilizează căile de respirație anaerobe pentru a crea ATP pentru diferite funcții celulare. În comparație cu respirația aerobă, care este condusă în principal de oxigen, căile anaerobe sunt considerabil mai puțin productive.
