Proteinele au multe funcții biologice, printre care facilitarea transportului, furnizarea de substanțe nutritive-cheie și acționarea ca facilități de depozitare. Rolul pe care îl joacă proteinele variază în funcție de forma, dimensiunea și orientarea acestora, ei locuiesc.
Proteinele joacă roluri importante în plante prin depozitarea nutrienților în semințele lor. În unele celule animale și țesuturi, proteinele stochează fier și alți nutrienți. Proteinele contractile ajută celulele și organismele să se miște prin facilitarea contracției musculare. Proteinele de transport se găsesc în toate speciile vii: ele aduc substanțe precum sânge, apă și glucoză de la o destinație la alta și se găsesc în membranele plasmatice și intracelulare.
