Ciupercile sunt organisme multicelulare, eucariote, în timp ce bacteriile sunt procariote cu celule unice. Celulele fungice au nuclee care conțin cromozomii și alte organele, cum ar fi mitocondriile și ribozomii. Bacteriile sunt mult mai mici decât fungi, nu au nuclee sau alte organele și nu se pot reproduce sexual.
Toate eucariotele, inclusiv plantele, animalele și ciupercile, au celule cu nuclei și o gamă largă de organele complexe care sunt folosite pentru a îndeplini diferite funcții biologice. Ciupercile au pereți celulari și se reproduc atât sexual cât și asexual prin utilizarea de spori. Ei nu sunt capabili de fotosinteza și trebuie să absoarbă substanțele nutritive prin ruperea materialului organic. Multe specii de ciuperci joacă roluri importante în ecosisteme prin descompunerea plantelor și animalelor moarte. Oamenii de știință estimează că pe Pământ există peste 2 milioane de specii de ciuperci.
Bacteriile sunt unul dintre cele două tipuri principale de prokaryotes împreună cu arhaea. Spre deosebire de ciuperci, celulele lor nu conțin nuclei. În schimb, ADN-ul lor se găsește pe un cromozom circular care plutește în jur în citoplasmă. Bacteriile reproduc în general prin fisiune, producând două celule fiice identice. În timp ce bacteriile se pot uni în structuri complicate, cunoscute sub numele de biofilme, ele nu sunt organisme multicelulare autentice. În schimb, fiecare bacterie individuală rămâne un organism separat.