Mammalogistii folosesc capcane vii, plase de ceață și chiar arme de foc pentru a captura și restrânge sălbatice pentru studiu. Instrumentele utilizate depind în mare măsură de mărimea speciilor de studiu.
Mammalogiștii care studiază mamiferele mici folosesc capcane vii pentru capturarea animalelor. O capcană viu constă de obicei dintr-un recipient cu colivie, cu o ușă și cu o pârghie sau o pedală. Plasarea unui momeală adecvată pe pedală împrăștie animalul spre el, împiedicând ușile. Mammalogiștii pun capcane vii pe căile pe care le folosesc mamiferele mici pentru a călători pe tot parcursul unui habitat.
Plasele silențioase sunt instrumente esențiale pentru capturarea liliecilor. Aceste plase fine de ochiuri de plasă sunt plasate de-a lungul căilor de zbor ale liliecilor. Liliecii nu echolocizează în timp ce traversează căile de zbor și zboară cu ușurință în plase.
Mammalogiștii folosesc de asemenea armele de foc pentru a trage atât săgețile tranchilizante, cât și plasele, de obicei pentru a captura specii mai mari. Liniștii necesită un grad de calcul, deoarece doza trebuie să fie suficientă pentru a menține animalul în jos, dar nu suficient de puternic pentru a-l face rău. Un pistol net poate fi folosit pe jos sau din aeronave. Unii mamaliști folosesc capcane vii mari, asemănătoare cu barilul, pentru animale mai mari, cum ar fi coioții sau urșii.
Mamologii folosesc, de asemenea, unelte pentru colectarea de date, incluzând saci de captare pentru limitarea vieții sălbatice și diferite scări și echipamente de măsurare pentru colectarea datelor fizice pe un animal.