Unele celule, inclusiv euglenele și diferitele specii bacteriene, utilizează proiecții asemănătoare unei coadă numită flagelă pentru a se deplasa pe o suprafață. Alte celule, inclusiv parametria, utilizează numeroase proiecții de păr numite cilia pentru locomoție.
Celulele pot avea una sau mai multe flageluri. Uneori, toate flagelurile sunt situate pe o parte a organismului, iar alteori acestea sunt împărțite între două sau mai multe părți. Cele mai multe specii care au flagelă folosesc un flagel pentru a se trage, mai degrabă decât pentru a împinge pe o suprafață. Ei tind să se miște într-un model tip torkscrew. Flagella sunt ancorate la celule prin structuri cunoscute sub numele de axoneme. Deoarece flagelul este o parte vie a celulei, ea are nevoie de nutrienți pentru a supraviețui. Aceste materiale sunt trecute prin axoneme și în citoplasmă din interiorul flagelului.
Cilia sunt mici proiecții care acoperă în general întreaga suprafață a celulei. O singură celulă poate avea mii de cilia. Se mișcă într-o mișcare coordonată, în spate și în față, pentru a propulsa celula pe o suprafață. Ca și flagelul, cilia sunt în mare parte compuse din proteine. Unele specii folosesc de asemenea cilia pentru alte scopuri decât pentru locomoție. De exemplu, cilia poate să se deplaseze astfel încât să împingă mâncarea într-o canelură orală sau să propulseze particule ofensive departe de suprafața celulei.
