Procariotele nu au mitocondriile. O procariote este o celulă care nu conține structuri legate de membrană numite organele. Un mitocondriu este o organelle, dar pentru că procariotele nu au organele, nu au mitocondriile.
Procarioții ar fi putut fi precursorii mitocondriilor. Musulul fosil observă că, în conformitate cu teoria endosimbibioasă a dr. Lynn Margulis, un anumit bacterion poate să fi înghițit un alt bacterion și să îl încorporeze ca un organism simbiotic. În timp, bacteria înghițit a devenit în totalitate dependentă de celula gazdă pentru a supraviețui. Aranjamentul a fost benefic pentru ambele specii, astfel încât bacteriile internalizate au fost reproduse și transferate către generațiile ulterioare. Aceasta a devenit originea celulei eucariote și a organelilor.