Există, de asemenea, un motiv genetic pentru diferența de înălțime dintre bărbați și femei. Studiile medicale au descoperit că există o variantă genetică în cromozomul X, care poate avea un rol important în determinarea înălțimii unui bărbat sau femeie.
Femeile au doi cromozomi X, ceea ce înseamnă că aceștia prezintă un risc mult mai mare de a fi susceptibili la această variantă genetică. Cercetătorii au descoperit că o genă care este implicată în dezvoltarea cartilajului poate fi modificată din cauza variantei genetice care este prezentă în cromozomul X. Deoarece uneori nu au capacitatea de a-și dezvolta oasele și cartilajul, femeile ajung să fie mult mai scurte decât bărbații.
Studiile au arătat, de asemenea, că femeile mai scurte tind să aibă mai mulți copii decât femeile care sunt înalte, în timp ce bărbații care sunt considerați ca înălțime medie tind să se reproducă mai mult decât omologii lor mai scurți. Această discrepanță reproductivă a determinat creșterea diferenței de înălțime dintre bărbați și femei în timp, datorită presiunilor evolutive.