După cum se arată pe site-ul NIH Genetics Home Reference, când moleculele ADN sunt reprezentate ca scări, treptele reprezintă perechile de bază ale ADN-ului. Bazele ADN sunt adesea reprezentate ca G, T și C, care reprezintă guanină, adenină, timină și citozină. Când două fire de ADN formează o spirală dublă, bazele se împerechează în mijlocul moleculei.
Bazele din ADN nu au aceeași dimensiune. Acest lucru afectează modul în care se pot împerechea în mijlocul unei molecule. Cele două mari baze sunt guanina și adenina, numite purine. Cele două baze mai mici, cunoscute sub numele de pirimidine, sunt timina și citozina. Scala principală a fosfatului de zahăr a moleculelor de ADN este menținută la aceeași distanță, pe întreaga lungime a helixului dublu. Ca rezultat, purinele trebuie să se cupleze cu pirimidine. Dacă două perechi de pirimidine au pereche, perechea de bază nu ar fi suficient de largă pentru a umple centrul spiralei dublu. Dacă două purine sunt asociate, perechea de bază ar fi prea mare pentru molecula ADN. Perechile purină-pirimidină sunt în mod specific A la T și G la C, deoarece diferitele baze sunt capabile să formeze fie două sau trei legături de hidrogen. Perechile de bază A la T și G la C au tendința să se întâmple deoarece aceste perechi sunt formate dintr-o purină și o pirimidină, ambele fiind capabile să formeze același număr de legături de hidrogen.
