Exemple de ciuperci saprofite pot include Rhizobium și Rhizopus. Organismele saprofite se caracterizează prin capacitatea lor de a se susține prin hrănirea cu materiale organice moarte și putrezite.
Ciupercile, cum ar fi Rhizobium, ajută la susținerea plantelor prin asigurarea amoniacului pentru vegetația înconjurătoare prin utilizarea azotului absorbit din aer. Rhizopus este un ciupercă frecvent întâlnită pe pâine, care o face să se descompună în nutrienți mai simpli pentru a fi folosiți de alte organisme. Mijloacele saprofite sunt esențiale pentru ecosistem datorită funcției lor de a preveni acumularea de materii organice moarte și de reciclare a nutrienților. Ei folosesc enzime pentru a descompune cadavrele animalelor moarte sau a plantelor în nutrienți, cum ar fi lignina, care servesc drept sursă de carbon pentru ecosistem.