Dezavantajul principal al reproducerii asexuate este lipsa diversității genetice în rândul descendenților care rezultă. Spre deosebire de reproducerea sexuală, care implică recombinarea a două seturi diferite de gene, un organism asexual posedă același genelor ca părintele său. Acest lucru poate duce la probleme dacă părintele are un defect genetic; fără ca alt părinte să înlocuiască gena, descendența posedă defectul.
Reproducerea asexuală este mai frecventă în rândul organismelor simple, cum ar fi bacteriile decât în cele complexe, cum ar fi mamiferele și păsările. Cu toate acestea, speciile extrem de evoluate prezintă ocazional reproducere asexuată. Un grup de șopârle americane numite whiptails, care apar în toate populațiile de sex feminin, ilustrează cel mai bine acest fenomen. Cu toate acestea, aceste șopârle au mai multe cromozomi decât majoritatea celorlalte șopârle, ceea ce ajută la compensarea problemelor asociate cu reproducerea asexuală.Există multe tipuri diferite de reproducere asexuală. Unele animale, cum ar fi bureții, produc structuri numite gemmules, care se transformă în organisme fiice. Alte organisme, cum ar fi planarienii, se reproduc prin procesul de fragmentare. Fragmentarea implică împărțirea organismului parenteral în două organisme fiice. Parthenogeneza este un tip special de reproducere asexuală care apare atunci când ova nefertilizată se dezvoltă într-un descendent. Partenogeneza a fost documentată în multe reptile și pești.
