Substraturile bazice pentru tripsină sunt proteine alimentare, conform Worthington Biochemical Corporation. Trypsina este o enzimă digestivă secretizată de pancreas. Trypsina separă proteinele alimentare mari de legăturile lor peptidice, spărgându-le în lanțuri de polipeptide mai mici.
În timpul digestiei, tripsina este secretă în secțiunea duodenală a intestinului subțire prin canalul pancreatic. Potrivit RSCB Protein Data Bank, tripsina acționează în principal lângă aminoacizii lizină și arginină în lanțurile mari de proteine. De-a lungul procesului digestiv, aceste segmente de proteine separate sunt acționate în continuare prin enzime digestive suplimentare, producând în final aminoacizi individuali. Acești aminoacizi mici sunt absorbiți prin căptușeala intestinului subțire și în fluxul sanguin.