Guvernul mayian a avut controlul asupra operațiunilor guvernamentale și afacerilor politice în primul rând la nivel de stat; fiecare stat-oraș sub controlul Mayan combina regulile militare cu legea religioasă. Deși unele state mayași s-au bucurat de autonomie, altele au căzut sub control din partea unor unități mai mari numite capitale.
Pe lângă nașii, figuri nobile, cum ar fi regi și preoți, au format vârful ierarhiei guvernului mayian. Nacomii au servit în termen de trei ani. În timpul mandatului lor, nacomii supravegheau operațiunile militare ale statelor lor guvernate. Ei au dezvoltat strategii militare pentru operațiuni pe termen scurt și pe termen lung și au organizat trupe pentru lupte. Orașele orășenești Maya nu aveau armate în picioare, dar îi chemau pe soldații de rezervă să lupte când era nevoie. Aproape 20 de unități de stat au existat în structura guvernului mayian. Aceste state au prezentat aspecte similare cu centrele urbane definite și zonele rurale exterioare. Civilii din cadrul orașelor-state s-au bucurat de protecție față de conducători și, la rândul lor, de siguranță, dar s-au confruntat cu repercusiuni pentru neascultarea comenzilor de superiori. Orașele-state au câștigat conducerea religioasă printr-o structură similară. Un singur mare preot a instruit grupuri de preoți, numiți batabi, să îndeplinească funcții administrative și să planifice evenimente și activități religioase. Consiliile locale, formate din oficiali ai orașului și consilieri, au ajutat băncile să organizeze și să aplice legi.