Robert E. Lee a început războiul ca consilier militar lui Jefferson Davis, primul și singurul președinte al Statelor Confederate ale Americii. Lee a devenit comandant al Armatei din Virginia de Nord, când comandantul său inițial, generalul Joseph E. Johnston, a fost rănit în bătălia de la Șapte Pene în mai 1862. În februarie 1865, Lee a fost numit general al șefilor armatelor Confederației, dar poziția confederației sa deteriorat prea mult pentru numirea lui Lee pentru a modifica rezultatul războiului.
El a fost responsabil pentru cele mai cunoscute înfrângeri suferite de armatele Uniunii, printre care se numără Luptele de Șapte Zile, Al doilea Bull Run, Fredericksburg, Chancellorsville și Cold Harbor.
