Poziția lui Thomas Jefferson asupra tarifului de protecție era una negativă, deși a acceptat că era necesar. Jefferson a crezut la un moment dat în comerțul liber, dar a ajuns să înțeleagă că nu va funcționa niciodată dacă toate națiunile nu au fost de acord cu aceasta, afirmă istoria SUA.
Jefferson a crezut că un guvern central puternic ar amenința inevitabil libertățile individuale. El a favorizat o societate agrară mai simplă. Deși tarifele ar încuraja creșterea culturii orașului pe care Thomas a disprețuit-o, el și-a dat seama că erau un rău necesar. Jefferson și-a dat seama că tarifele și taxele erau singurele modalități de a fixa datoriile națiunii. Deși Jefferson a favorizat tariful, a făcut puțin pentru al susține, iar partidul său democrat-republican a manifestat puțin interes în acest sens, afirmă Proiectul de istorie din Carolina de Nord. Jefferson a anticipat consecințele tarifului care a susținut economia de producție și industrială, dar părerea lui a fost că o economie puternică și o națiune autosuficientă erau mai importante decât visul său pentru o societate agrară. Deși unii dintre susținătorii lui Jefferson s-au simțit trădați de poziția sa asupra tarifului, în spatele deciziei sale a existat, fără îndoială, un raționament puternic și logic. Jefferson a stabilit, de asemenea, tariful ca mijloc de evitare a impozitării directe a cetățenilor, afirmă The Freeman.