Șoarecii sunt înotători buni și au capacitatea de a înota pentru perioade prelungite de timp. Cu toate acestea, nu este o activitate pe care soarecii se bucură, deoarece provoacă o mare cantitate de anxietate.
Prin cercetări în care oamenii de știință au plasat șoareci în medii apoase, sa constatat că, deși rozătoarele pot să înoate, ei încearcă să iasă din apă la prima ocazie.
De asemenea, șoarecii pot înota sub apă. Datorită abilităților lor de înot, șoarecii adulți nu se îneacă de obicei când plouă. Cu toate acestea, în cazul în care apare un inundații, șoarecii adulți se deplasează adesea la înălțimi mai mari. Ei își părăsesc uneori tinerii în urmă pentru a se salva.