Clorura de beriliu este o moleculă nepolară. Forma lui BeCl2 este liniară, cu beriliul central legat de fiecare parte la un atom de clor. Electronegativitățile atomilor de clor, prin urmare, se anulează, lăsând o moleculă nepolară.
Clorura de beriliu este un exemplu de moleculă cu deficiență de electroni, deoarece atomul de beriliu are doar un total de patru electroni, în timp ce atomii din cele mai covalente molecule împart opt. În mod normal, atomi cum ar fi beriliul localizat în primul sau al doilea grup pe legăturile ionice din tabelul periodic, care le permite să ajungă la o configurație de gaz nobil fără a împărți electronii. Cu toate acestea, beriliul este semnificativ mai mult electronegativ decât majoritatea atomilor din aceste grupuri, motiv pentru care formează legături covalente.