Antibioticele vindecă o infecție dentară prin vizarea și uciderea bacteriilor specifice care au provocat infecția. Adesea, acestea se utilizează împreună cu un tratament fizic, cum ar fi tratamentul canalelor radiculare sau drenajul puroi, pentru a opriți infecția și restaurați sănătatea dintelui.
Clindamicina și antibioticele pe bază de penicilină sunt utilizate cel mai frecvent pentru a trata infecțiile orale, inclusiv amoxicilina. Penicilina și amoxicilina sunt ambele antibiotice beta lactamice și ucid anumite tipuri de bacterii prin atacarea pereților celulari ai bacteriilor și fără a le permite să sintetizeze componentele pentru a face noi pereți celulari. Fără pereții lor celulari, aceste specii de bacterii mor rapid. Clindamycin interferă cu anumite specii de bacterii care au capacitatea de a produce noi proteine, ceea ce îi împiedică să crească. Sistemul imunitar uman ucide repede bacteriile rămase.
Antibioticele împreună cu un alt tratament, cum ar fi un canal rădăcină, sunt foarte eficiente la eliminarea infecțiilor gingiilor și maxilarului. Dacă antibioticele nu sunt administrate corect, totuși, infecția se poate întoarce. Dacă antibioticele sunt ineficiente, atunci există riscul ca bacteriile care cauzează infecția dinților să devină rezistente la această categorie de antibiotice în viitor. Dacă bacteriile devin rezistente la antibiotice, atunci infecția care urmează va fi mult mai greu de tratat.