Țestoasele respiră prin absorbția oxigenului în plămâni și eliberarea dioxidului de carbon în timpul expirării. Țestoasele de apă dețin oxigen în plămâni pentru perioade mai lungi decât alte animale, permițându-le să rămână complet scufundate timp de multe ore, în aer liber.
Unele țestoase pot folosi și cavitățile lor anale pentru a respira. Aceste broaște țestoase trag apa în cavitățile lor anale, unde saculetele colectează apa și filtrează oxigenul. Acest lucru permite ca broasca testoasa sa ramana scufundata fara a mai trebui sa suprapune aerul. Această metodă de respirație s-ar fi putut dezvolta pentru a proteja broasca țestoasă împotriva prădătorilor sau pentru a acționa ca o formă de respirație de rezervă în cazul în care broasca țestoasă nu poate suprafata.