Sistemul digestiv menține homeostazia prin crearea unui echilibru corect al pH-ului în mediul gastric. În plus, prin menținerea raportului corect al enzimelor, sistemul digestiv stimulează bacteriile benefice care inhibă boala și produc substanțe biologice organismul are nevoie de vitamina K.
Homeostazia este echilibrul pe care organismul îl susține pentru a continua să funcționeze corect. Toate sistemele corporale, inclusiv sistemul digestiv, contribuie la homeostazie. Organismul menține homeostazia folosind atât mecanisme pozitive, cât și negative. Feedback-ul negativ apare când organismul sesizează un dezechilibru, iar diferitele sisteme funcționează pentru a contrabalansa și pentru a restabili echilibrul adecvat. Răspunsul pozitiv se întâmplă atunci când organismul simte o schimbare și lucrează pentru ao îmbunătăți.
Balanța pH-ului corpului, raportul său acid și alcalin, este o parte importantă a homeostaziei globale. În gură, salivă este doar puțin acidă. Cu toate acestea, sistemul digestiv are nevoie și menține un mediu foarte acid, în care să se descompună rapid produsele alimentare. Împreună cu reglementarea echilibrului pH-ului, sistemul digestiv menține microflora, cum ar fi acidophilus și bifidobacterium, care descompun carcinogeni care cauzează cancer și alte infecții. După ce descompune produsele alimentare printr-un sistem complex de conveieri, sistemul digestiv transmite substanțele nutritive necesare sistemului circulator pentru absorbție de către organism.