Fizicianul Ernst Ruska și inginerul german Max Knoll sunt creditați să creeze primul microscop electronic în 1932. L-au permis cercetătorilor o mărire și o rezoluție mai mari decât microscoapele tradiționale.
Teoria microscopului electronic se bazează pe lucrările lui Hermann von Helmholtz și Ernst Abbe, doi fizicieni. Ei au susținut că există lungimi de undă care erau "mai mici decât lumina" și astfel invizibile cu ochiul liber. Aceasta a fost prima teorie a electronilor.
După Abbe și von Helmholtz, un candidat la doctorat numit Louis de Broglie a elaborat ecuații care ar duce în cele din urmă la descoperirea undelor electronice. El a susținut că fiecare particulă produce un val de electroni la o anumită frecvență.Folosind lentile magnetice care direcționează electroni, aceste valuri de electroni au fost în cele din urmă capturate și apoi îndreptate spre obiecte. Prin direcționarea electronilor la un obiect și măsurarea frecvenței la care se învârt înapoi, se poate forma o imagine. Acest lucru a dus la primul microscop electronic.