Începând cu secolul al 1-lea, când romanii au experimentat cu mărirea obiectelor mici, privindu-i prin sticlă, microscopul sa schimbat considerabil cu versiunile moderne ale dispozitivului capabile să prezinte imagini tridimensionale ale obiectelor la nivel sub-atomic . Progresele cele mai notabile ale tehnologiei microscopice au avut loc în secolul al XIX-lea.
Vision Engineering Ltd., un producător mondial de microscoape, oferă o cronologie a tehnologiei microscopice, pornind de la testarea de către romani a unor bucăți de sticlă care erau groase în mijloc și subțiri de-a lungul marginilor, examinând obiecte mici prin ele. Primele microscoape reale au fost totuși o lupă cu o singură putere, capabilă să ofere o vedere clară asupra insectelor. În 1830, Joseph Jackson Lister a creat un microscop în care lentilele au fost distanțate suficient de îndepărtate pentru a evita denaturarea obiectului vizat. Până la mijlocul secolului al XIX-lea inventatorii au creat primul din ceea ce seamănă cu microscoapele moderne. Mai multe companii din diferite țări, inclusiv Statele Unite, au început să producă aceste instrumente optice.
Potrivit organizației Nobel Prize, Ernst Ruska a dezvoltat microscopul electronic în 1938. Cu această versiune a dispozitivului, utilizatorii au putut să se bucure de o rezoluție semnificativ îmbunătățită. În 1981, Heinrich Rohrer a inventat microscopul de scanare care oferă imagini tridimensionale la nivel atomic.
Microscoapele de astăzi, conform Vision Engineering Ltd., au atins limita de proiectare cu puține modificări de la inventarea lui Rohrer. Cu toate acestea, producătorii continuă să încerce să facă aparatele mai prietenoase, conform companiei.