Potrivit catolicilor americani, numeroase miracole au fost atribuite Sfântului Francisc de Assisi, cele mai multe dintre ele având legătură cu capacitatea sa de a comunica cu animalele și de a influența natura. Există și povești despre abilitatea sa de a vindeca oamenii si animalele cu o atingere. Aceste povești de vindecare au persistat după moartea lui Francis, când pelerinii la locurile care aveau relicvele sale sfinte au fost vindecați.
Una dintre cele mai faimoase miracole atribuite Sfântului Francisc de Assisi este capacitatea de a predica păsărilor și altor animale sălbatice. Cu o ocazie, el sa apropiat de o turmă mare de păsări care nu au zburat când sa apropiat, ci mai degrabă a așteptat cu răbdare pentru el. Sfântul Francisc de Assisi a predat o predică păsărilor, care au început să cânte când a vorbit. Într-o altă ocazie, Francis a liniștit un lup care ucide animalele, astfel încât să nu-i deranjeze niciodată pe oameni.
Sfântul Francisc de Assisi a făcut minuni și pentru oameni. Câteva dintre minunile sale au implicat vindecarea oamenilor atât din cauza bolilor fizice cât și a celor psihice. El a convins, de asemenea, mulți criminali să se pocăiască de crimele lor și să se împace cu biserica, incluzând o instanță în care a convins trei hoți care i-au furat de la el pentru a reveni la ceea ce luaseră și pentru a se alătura ordinului franciscan.