Un lanț lung de mulți aminoacizi este numit polipeptidă. O polipeptidă are sute sau chiar mii de aminoacizi legați împreună, în timp ce o peptidă este un lanț mai mic de aminoacizi. După cum sugerează și numele, polipeptidele sunt compuse din peptide multiple.
Un lanț lung de aminoacizi poate sau nu poate fi considerat o proteină, de asemenea. În general, lanțul de bază al acizilor este considerat o polipeptidă până când ia forma finală tridimensională, care este funcțională. În plus, anumite proteine sunt compuse atât din polipeptide, cât și din alte grupuri moleculare numite cofactori sau grupuri protetice. Proteinele sunt responsabile pentru o gamă largă de sarcini biologice în majoritatea organismelor vii.