Fiecare moleculă organică conține carbon. Diferitele clasificări ale compușilor organici sunt determinate de numărul atomilor de carbon din cadrul compusului, de tipul legăturilor pe care le formează unul cu celălalt și de tipul de obligațiuni pe care form cu alte elemente.
Moleculele organice conțin în mod obișnuit una sau mai multe legături carbon-hidrogen, făcând hidrogenul cel de-al doilea element cel mai comun într-un compus organic.
Multe molecule biologice asociate cu procesele de viață sunt organice, inclusiv ADN, grăsimi, zaharuri și proteine. Sursele de combustibil, cum ar fi metanul și alcoolii, sunt și compuși organici. Opusul moleculelor organice sunt moleculele anorganice, care, de obicei, nu conțin carbon.