Elementul hidrogen are trei izotopi diferiți: protium, deuteriu și tritiu. Fiecare izotop are un proton, dar un număr diferit de neutroni. Un nucleu contraum are zero neutroni, un nucleu de deuteriu are un neutron și un nucleu de tritiu are doi neutroni.
Protiumul este de departe cel mai comun izotop, cu peste 99% din totalul hidrogenului din atmosferă fiind contraum. Deuteriul este al doilea cel mai obișnuit. Se utilizează ca parte a oxidului de deuteriu în reactoarele nucleare. Tritiumul este singurul izotop radioactiv al hidrogenului și este produs de reactoare nucleare, precum și ca parte a bombei cu hidrogen.