Eubacteriile se încadrează în patru categorii principale, care sunt eubacterie gram-pozitive, proteobacterii, cianobacterii și spirochete. Eubacteriile sunt mult mai frecvente decât arheebacteriile, care sunt membri apropiați ai diviziunii prokaryote. Eubacteria trăiește în multe zone din întreaga lume, incluzând unele dintre cele mai extreme și inospitaliere.
Multe eubacterie se disting numai la nivelul celular cel mai complex. Eubacteriile gram-pozitive sunt identificate și clasificate pe baza unei tehnici numite colorare gram. Această metodă implică detectarea volumului de peptidoglican care există în pereții celulari ai acestor organisme. Dacă această substanță este prezentă, coloranții specifici se referă la această informație înapoi la cercetători, care pot apoi clasifica organismul ca gram-pozitiv. Aceste bacterii sunt dăunătoare, dar nu mortale. La om, ele provoacă boli cum ar fi gâtul streptococilor și infecțiile respiratorii. Proteobacteria include eubacteriile cele mai răspândite și mai active. Un tip de proteobacterii este bacteria enterică, care include specia E. coli. Acest grup bacterian include organisme care fixează azot prin transformarea gazului în substanțe folosite apoi pentru a crea aminoacizi și acizi nucleici. Cianobacteriile includ organisme care produc oxigen și fac obiectul fotosintezei. Aceste bacterii sunt denumite în mod obișnuit algele albastre-verzi și apar în lacuri, cursuri și alte corpuri de apă. În cele din urmă, spirochetele sunt eubacterie în formă de spirală care există în forme aerobe și anaerobe.
