Exemple de bacterii facultative anaerobe includ salmonella și E. coli. bacteriile facultative anaerobe sunt membre ale familiilor taxonomice Enterobacteriaceae, Vibrionaceae și Pasteurellaceae. Multe dintre speciile din aceste familii sunt agenți patogeni la om, alte animale sau plante.
Bacteriile anaerobe facultative sunt capabile atât de respirație aerobă, fie de fermentație sau de respirație anaerobă. Multe organisme, pe lângă bacterii, sunt anaerobe facultative și includ niște ciuperci și viermi de polietiți. Bacteriile anaerobe bacteriene sunt omniprezente și comune în sol, apă și în organisme. Nu toate speciile provoacă boală, ci fac parte din flora intestinală normală a animalelor. Unele specii, cum ar fi E. coli, sunt adesea inofensive.
Enterobacteriaceae este familia care conține bacteriile uzuale provenite din alimente salmonella și E. coli, împreună cu multe alte grupuri de agenți patogeni periculoși. Speciile Vibrionaceae includ vibrio cholera, o boală mortală răspândită prin canalizare și alimente contaminate. Această specie provoacă cantități mari de apă în intestine, ceea ce duce la deshidratare rapidă. Vibrionaceae include, de asemenea, fotobacterium, un grup care produce lumină și poate fi găsit în organele producătoare de lumină ale unor pești de adâncime. Pasteurellaceae includ speciile pastuerella, care sunt agenți patogeni obișnuiți ai animalelor domestice, precum și hemofil, care sunt obișnuiți în tractul respirator superior și necesită supraviețuirea unei componente a hemoglobinei.
