Organismele strâns legate de ele au adesea structuri similare în corpul lor, în ciuda stilului lor de viață diferit. Cea mai simplă explicație pentru astfel de asemănări este că ambele specii au coborât dintr-un strămoș comun cu caracteristici similare. Aceasta este uneori verificată de înregistrarea fosilă.
Asemănările anatomice dintre diferitele grupuri de organisme, dintre care unele trăiesc în medii diferite față de celelalte, susțin ferm teoria despre descendența comună. Delfinii, de exemplu, trăiesc ca niște pești mari, dar asemănarea lor cu peștii este superficială. La fel ca toate mamiferele placentare, delfinii au plămâni și jawbones și își dau tânără intern. Cea mai simplă explicație pentru aceste asemănări cu câinii, pisicile și primatele este că delfinii sunt mai apropiați de alte mamifere decât de peștii în care trăiesc. Un alt exemplu de anatomie analogică între specii este membrul tetrapod. Forma de bază a acestei structuri este un singur os lung, atașat la un umăr la un capăt și un cot la celălalt. Sub cot, două oase mai mici se extind până la încheietura mâinii, care se termină în oase mici pentru degete și degetele de la picioare. Această structură este universală între mamifere, păsări, reptile și amfibieni, dar necunoscută printre nevertebrate. Cea mai explicită explicație a acestui fapt este că toate tetrapodele au coborât de la animale cu membre similare, dar insectele nu au făcut acest lucru.
