Funcția principală a plămânilor unui șobolan este de a susține respirația. Respirația se realizează prin respirație în care aerul intră în corp prin nas sau gură, călătorește în jos în trahee și în bronhiile plămânilor .
Alveolele, ramurile mici ale bronhiilor, sunt special concepute pentru a efectua schimb de gaze la nivel celular. Oxigenul din alveole intră în sânge prin difuzie, iar dioxidul de carbon intră în plămâni. Acest dioxid de carbon este expulzat atunci când șobolanul se exhalează.
Plămânii sunt înconjurați de coaste și de diafragma musculară. Diafragma se contractează în timpul inspirației, creând presiune negativă și tragând aer în plămâni. Atunci când diafragma se relaxează, se produce expirarea.
