Câinii Shiba Inu nu sunt hipoalergenici. Câinii hipoalergenici sunt meniți să producă alergeni la o rată mai scăzută decât cea normală. Cu toate acestea, cercetările arată că astfel de rase de câini ar putea să nu existe.
Niciunul canin nu este cunoscut ca fiind complet hipoalergenic. Cu toate acestea, unii câini sunt promovați ca având mai puțini alergeni sau ca fiind mai compatibili cu persoanele care au alergii deoarece au blană care nu atrage substanțe care provoacă alergii. În timp ce nivelul alergenelor variază de la câine la câine, această variație nu se bazează pe rasa câinelui.
Câinii Shiba Inu au un strat dublu cu un vârf rigid, rigid și cu un fund moale și gros. Părul de pe fețe, urechi și picioare este scurt și neted.
